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Post by alamin447 on Aug 4, 2023 23:58:26 GMT -5
采样的bam文件或从头组装的转录本来重复分析。结果,观察到相同的模式(图S 17和S 18),支持我们分析的稳健性。我们的分析表明,剪接熵和剪接包含水平的变化对组织特异性剪接差异具有相当的贡献。 图4 图4 人体配对组织之间剪接复杂性和 Ψ 值的比较。桑基图显示了组织间事件所属群体的转换。根据每个组 织中的剪接复杂性和 Ψ 值对事件进行分类,每行代表 Telegram 用户号码列表一个组织。K{n}_{m},n为拼接复杂度类别,m为Ψ类别。K1_Low:复杂度 = K1 且 0 < Ψ ≤ 0.2;K1_Middle:复,B条形图显示大脑和小脑中不同群体的事件频率,并带有来自 Ensembl 数据库的转录本注释 全尺寸图像 例如,SCN2A基因的第 16 号外显子 (2:165,327,155–165,327,202) 具有相似的 Ψ 值,但大脑和小脑之间的剪 接复杂性不同。具体来说,该外显子在小,而在大脑中只有一种剪接模式(图S 19 A)。另一方面,CADM3基因的外显子2(1:159,189,771–159,189,872)在大脑和小脑中有两种剪接模式,但两种组织中的Ψ值有显着差异(0.112 vs. 0.271)(图S 19 B) )。 进化古老的AS事件在哺乳动物进化枝同剪接年龄事件的 Ψ 值,获得了有价值的见解 [ 11 , 12]。我们询问
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